Abstract

CHAVEZ, Fredy Yasmany  and  GALVEZ LIO, Daniel. Aplicación del modelo de programación CUDA en la simulación de la evolución de secuencias genéticas. Enfoque UTE [online]. 2017, vol.8, n.2, pp.78-93. ISSN 1390-6542.  https://doi.org/10.29019/enfoqueute.v8n2.159.

La simulación resulta un poderoso enfoque en el estudio de la evolución molecular de secuencias genéticas y su divergencia a lo largo del tiempo; existen diferentes procedimientos de simulación de la evolución molecular, pero todos ellos poseen alta complejidad computacional, y en la mayoría de los casos las secuencias genéticas poseen gran tamaño, aumentando los tiempos de ejecución de las implementaciones de estos procedimientos. A partir de esta problemática, en este trabajo se describe una propuesta de modelo de paralelización utilizando la tecnología CUDA y los resultados de esta propuesta se comparan con su equivalente secuencial.

Keywords : simulación; evolución molecular; Markov; programación paralela; CUDA..

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