CHAVEZ, Fredy Yasmany    GALVEZ LIO, Daniel. Aplicación del modelo de programación CUDA en la simulación de la evolución de secuencias genéticas. []. , 8, 2, pp.78-93. ISSN 1390-6542.  https://doi.org/10.29019/enfoqueute.v8n2.159.

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La simulación resulta un poderoso enfoque en el estudio de la evolución molecular de secuencias genéticas y su divergencia a lo largo del tiempo; existen diferentes procedimientos de simulación de la evolución molecular, pero todos ellos poseen alta complejidad computacional, y en la mayoría de los casos las secuencias genéticas poseen gran tamaño, aumentando los tiempos de ejecución de las implementaciones de estos procedimientos. A partir de esta problemática, en este trabajo se describe una propuesta de modelo de paralelización utilizando la tecnología CUDA y los resultados de esta propuesta se comparan con su equivalente secuencial.

Simulation is a powerful approach in the study of the molecular evolution of genetic sequences and their divergence over time; there are different procedures for the simulation of molecular evolution, but all of them have high computational complexity, and in most cases the genetic sequences have large size, increasing the execution time of the implementations of those procedures. Based on this problem, this paper describes a proposal of parallelization model using CUDA technology and the results of this proposal are compared with its sequential equivalent.

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